process explorer ile bu msnmsgr dosyalarının nerde çalıştığına bi bak. programı açınca sütun yazılarına sağ tıkla ordan command line'a tıkla programın yerini gör
Çoklu msn açma yaması felan varsa o etkiliyor olabilir.Her msn'i kapattığında kapanmış gibi gözüksede kapanmıyabiliyor.